Modele anatomiczne czaszki odgrywają znaczącą pracę w edukacji medycznej, badaniach naukowych oraz w praktyce medycznej. Ich znaczenie pochodzi z konieczności precyzyjnego poznania budowy czaszki, jaka jest jednym z wysoce skomplikowanych elementów ludzkiego szkieletu. Modele anatomiczne dają one na określone przestudiowanie układu kostnego, wzajemnych zależności pomiędzy poszczególnymi elementami czaszki oraz na pozytywniejsze poznanie mechanizmów urazów, deformacji i patologii. Modele anatomiczne czaszki są też szeroko wykorzystywane w stomatologii. Budowa czaszki ma istotne znaczenie w diagnostyce i pomaganiu schorzeń jamy ustnej, wad zgryzu czy problemów ortodontycznych. W ortodoncji modele anatomiczne czaszki pomagają w analizie struktury żuchwy i szczęki, co gwarantuje dokładne zaplanowanie leczenia aparatami ortodontycznymi. Nie bez znaczenia są też modele anatomiczne czaszki w medycynie sądowej i antropologii. Modele anatomiczne czaszki, które różnią się stopniem szczegółowości oraz surowcem wykonania. Jednym z znacznie oryginalnych typów są normalne modele anatomiczne czaszki ludzkiej, przedstawiające główne kości i ich połączenia. Modele anatomiczne tego typu są powszechnie wykorzystywane w edukacji także służą do nauki podstawowej anatomii czaszki. Inną grupę stanowią modele anatomiczne czaszki z ruchomymi elementami, które umożliwiają na lepsze poznanie połączeń pomiędzy kośćmi i procesów ich ruchu, co jest szczególnie przydatne w ortodoncji i chirurgii szczękowej. W bardziej zaawansowane modele anatomiczne czaszki mogą być rozkładane na pojedyncze kości, co pozwoli na określone badanie pojedynczych elementów. Dzięki temuż można zauważyć, w który sposób poszczególne kości są ze sobą powiązane, jakie mają kształty oraz jakie grupy anatomiczne się na nich znajdują.
Tego typu modele anatomiczne są szczególnie przydatne w nauce anatomii i chirurgii, ponieważ dają wnikliwą analizę struktur trudnych do zobaczenia w rzeczywistej czaszce. Nowym rodzajem są modele anatomiczne czaszki z zaznaczonymi strukturami anatomicznymi, które pomagają w edukacji szczegółowej anatomii. W takich modelach drugie czynniki czaszki są oznaczone kolorami, co pomaga ich identyfikację. Na przykład kości tworzące podstawę czaszki mogą być podkreślone innym odcieniem niż kości sklepienia, a kanały nerwowe i otwory mogą być wyróżnione w sposób umożliwiający ich zapamiętanie. Jest to zwłaszcza dobre dla uczniów medycyny, którzy muszą opanować trudną terminologię anatomiczną. Dla bardziej zaawansowanych użytkowników dostępne są modele anatomiczne czaszki z odwzorowanymi strukturami nerwowymi i naczyniowymi. Tego typu modele anatomiczne przedstawiają przebieg nerwów czaszkowych i naczyń krwionośnych, co jest niebywale cenne w nauce neuroanatomii i neurochirurgii. Dzięki nim można prześledzić ścieżki rozwoju nerwów, ich ulokowanie względem struktur kostnych także miejsca, w których mogą być one uciskane lub uszkadzane. Współczesna technika daje także na tworzenie projektów czaszki w technologii druku 3D. Modele anatomiczne te mogą być robione na podstawie konkretnych danych tomograficznych, co pozwoli na odwzorowanie indywidualnych cech anatomicznych pacjenta. Takie modele anatomiczne są wyjątkowo przydatne w planowaniu operacji chirurgicznych, ponieważ dają lekarzom wcześniejsze przećwiczenie procedur na dokładnym odwzorowaniu czaszki pacjenta. Metoda ta jest także używana w rekonstrukcji buzi w przypadkach urazów i deformacji wrodzonych.
